转基因油和非转基因油的区别是出油量不同。转基因大豆含油量高于非转基因大豆，压榨出来的豆油，转基因大豆高于非转基因大豆。口感不同，非转基因大豆的口感相较于转基因大豆好一些。一些研究学者认为，对于基因的人工提炼和添加，可能在达到效果的同时，也增加和积聚了食物中原有的微量毒素。作物可能会被施以过多的草甘膦除草剂，这些除草剂可能随大豆油进入人体，影响人体的健康。