长江的入海口在上海市崇明岛。长江口水域是上海市重要水源地，同时兼具工农业取水、通航、纳污、围垦、生态等多种功能，长江口已成为上海市建设世界级城市的重要支撑之一，其水资源的开发、利用和保护已成为人们关注的焦点。

长江口不仅是多种生物周年性溯河和降河洄游的必经通道，也是亚太候鸟迁徙的主要驿站。近几年出现了将大量滩涂湿地转为城市建设用地的现象，不利于长江口湿地生态系统的保护，如何有序开发长江口滩涂资源，合理保护长江口湿地，对于维持长江口地区生态环境和经济的协调发展有着重大的意义。