最简单的办法是完全换水。餵食后四小时把旧有脏水放掉、抽掉、倒掉。然后以中等硬度的刷子和清水刷洗容器四壁和底面。清洗时先把龟放到一个塑胶盆里或池畔的陆地上，当然是跑不掉的地方。注入温度适宜的清水后再把龟放回水中。

有些种类的沼泽龟或水龟不太能适应完全换清水，但不久便能习惯这种作法和给它带来的干扰。完全换水仍有一个缺点，会诱使彩龟加速排尽肠中粪便，把刚换过的水又弄脏了，所以最好在换水后不久察看一下养殖箱(池)，把粪便清除。