洋葱花球顶部少数蒴果变黄开裂露出黑色种子时，分期分批将花球剪下，可以倒挂在屋檐下（防止曝晒）后熟，适当晒干后用隔湿材料将搓下的种子包装贮藏，防止种子混杂、烟熏、虫蛀和受潮而霉坏。
洋葱鳞茎定植有秋栽和春栽两种。在长江流域，秋栽一般在9-10月定植，春栽在第三年6月份定植。定植株距16厘米、行距23厘米；或者行距55厘米，穴距35厘米，每穴栽2-3个鳞茎。洋葱属异花授粉植物，需隔离繁种，周围300米内不能有葱蒜类作物留种田。冬季及时浇封冻水，适当覆盖落叶，枯草，保证安全过冬。