小狗眼睛肿胀主要考虑细菌性感染导致，比如结膜炎、角膜炎等疾病。同时，也有可能是由于外伤性原因导致的角膜溃疡引起。首先，感染性原因可以使用含有土霉素、泰乐菌素等成分的眼药。其次，如果是外伤导致角膜溃疡，建议除了使用抗感染药物之外，还需要使用修复角膜的药物。最后，治疗期间需要佩戴脖圈。