目镜测微尺必须用镜台测微尺来校正是因为目镜的放大倍数不同，就必须用镜台测微尺重新对目镜测微尺进行校正，这样的目镜测微尺测量的长度才是目前状态下的准确长度，与成像清晰无关，成像清晰与否是由调节旋钮调节的。

由于镜台测微尺与细胞标本是处于同一位置，都要经过物镜和目镜的两次放大成象进入视野，即镜台测微尺随着显微镜总放大倍数的放大而放大；因此从镜台测微尺上得到的读数就是细胞的真实大小，所以用镜台测微尺的已知长度在一定放大倍数下校正目镜测微尺，即可求出目镜测微尺每格所代表的长度，然后移去镜台测微尺，换上待测标本片，用校正好的目镜测微尺在同样放大倍数下测量微生物大小。