因为木瓜是热带的水果，生长发育是在高温、高湿的气候环境中进行的，故对低温很敏感。在储藏保鲜过程中，热带水果会由于储存温度过低发生冷害（水果在0℃以上的低温中表现出生理代谢不适应的现象），严重影响其品质和商品价值。

冷害的现象有时不是立即显现出来的，具有一定潜伏性。因此，木瓜、香蕉、芒果等从冰箱里拿出来后，其表皮很快就会出现褐色或黑色的斑点。木瓜鲜果中含有较多的单宁和有机酸，糖含量相对较低，使其口感酸涩，不宜生食。但其果实营养丰富，富含维生素。