神舟二号飞船于北京时间2001年1月10日1时0分3秒在酒泉卫星发射中心发射升空，于2001年1月16日19时22分在内蒙古中部地区成功着陆，在太空飞行了6天零18小时/108圈。

神舟二号主要由飞船系统和火箭系统等系统组成。其中，飞船系统由中国航天科技集团公司所属的中国空间技术研究院、上海航天技术研究院为主研制。与神舟一号飞船相比，神舟二号飞船的系统结构有了新的扩展，技术性能有了新的提高，飞船技术状态与载人飞船基本一致。火箭系统采用由中国运载火箭技术研究院研制的长征二号F捆绑式火箭，其总指挥为黄春平。