自助值机了还能托运，值机是值机，托运是托运，安检是安检，都不一样，也不冲突。在网上办理完值机手续之后，还有行李要托运，请提前到达机场，在航班截止办理时间前到柜台办理完行李托运手续，各机场柜台截止办理时间请咨询始发当地机场。

办理好网上值机以后，可以持有效证件（购票时使用的证件）前往机场相关航空公司的柜台领取登机牌和办理行李托运，也可以持有效证件通过机场的自助值机专柜打印登机牌，步骤：扫描或输入证件号码，确认航班信息，确认是否有托运行李及件数，打印登机牌。有行李托运的话，自助领取登机牌以后还要前往行李托运柜台办理托运。