1、入学考试不同。函授专升本都必须要通过成人高中教育，在拿到相关的毕业证书以后还需要被学校的继续教育学院所录取，入学方面有一定的要求。自考本科没有入学考试的要求，考生完全是自力更新，直接学习。
2、学习时间不同。函授专升本必须要在3年的时间里面完成学习，不可以小于三年。自考则没有相关的时间规定。
3、费用不同。函授专升本和平常的全日制教育缴费模式差不多，都是按照年费收取的，而自考本科则是考一科，收取一科的费用。
4、学习方法不同。函授专升本多数以面授的形式出现，必须要学校组织学习和考试。自考的话是完全通过个人努力来完成学业的。
5、毕业形式不同。函授专升本毕业以后可以得到成人教育毕业证书，可以直接申请学历证书。而自考本科则需要在完成专业规定的课程后，方可递交学历证书的申请证明。